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鲤科鱼类散在重复序列研究进展

  鲤鱼分散重复研究进展

  4月29日,BMC进化生物学发表了一篇题为“HAmo SINE的多源基因依赖于其合作者LINE积极扩大和正在进行的鲤科动物基因组回顾”的研究论文。报道了近年来对cy类物种分散重复序列研究的进展。本文是在何顺平研究员的指导下,由中国科学院水生生物研究所鱼类系统生物学与生物地理学系博士生赵超波博士完成的。童超等在BMC Genomics(Tong等人,2009)发表的一篇论文中报道了一种将珠粒分选系统应用于散布重复分离的方法。从isolated中分离出silver和一个年轻的SINE家族(HAmoSINE)和附着有转座子的LINE家族(HAmoLINE2),并发现SINE家族借助其编码的转座酶系统实现了其自身的近期增殖由HAmo LINE2在其基因组上。
\\ u0026>本文遵循以前的研究进一步调查HAmoSINE和HAmoLINE在来自鲤科12个亚科的17个代表性物种的基因组中的进化模式。基于磁珠分选技术,对17个代表性鲤鱼物种的基因组中散布的重复序列进行了大规模的捕获。基于特征性诊断核苷酸的存在,发现四个HAmoSINE基因(亚家族)基因在整个cy species族或特定谱系中活跃地增殖,HAmoSINE在这些鱼中的拷贝数为104至106。探讨了斑马鱼基因组的亚家族及其物种分布。本文结果显示HAmoSINE通过感染HAmoLINE在整个鲤科动物寄生虫中广泛扩展。 (来源:邹明谷中国科学院水生生物研究所金惠)

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