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新型DNA测序算法让“重复片段”不再神秘

  新的DNA测序算法使“重复片段”不再神秘

  \\ u0026美国华盛顿大学的一个研究小组表示,他们使用了一种名为“mrFAST”的新型DNA测序算法来准确估计重复的基因片段,并对其作用做出初步判断。相关研究发表在8月30日的“自然·遗传学”杂志上。据了解,截至2003年底,绝大多数人类基因组已经确定。然而,基因组的许多区域仍然没有测序。主要原因是每个染色体中央区域存在大量的重复DNA序列,称为着丝粒。这些重复通常包含许多功能未知的基因,不同个体的副本具有不同的拷贝数。许多科学家认为,狼疮等疾病,智力低下,精神分裂症,色盲,牛皮癣和年龄相关性黄斑变性是相关的。因此,统计的重复次数,内容和位置的检测尤为重要。负责研究的华盛顿大学基因组科学学院的肯·爱尔康(Ken Alcon)表示,该算法使用了一种新的DNA测序技术,能够准确检测重复片段中具有特定功能的基因。同一篇论文的另一位合着者Jeffrey Kidd说,目前大多数基因组测序方法由于困难而没有考虑基因重复。 mrFAST将成为人类基因组测序中最复杂的区域的一种解决方案,可准确计数个体实际拥有多少重复的基因片段。以前有很多科学家研究这个,但没有统计重复片段的具体数目。例如,科学家发现有些人基因重复的增加使其免疫HIV病毒,但不确定其增加多少。据了解,目前该研究小组正在对不同种族的三名健康人的基因组进行研究,初步确定了不同个体在重复基因片段中的差异。这些基因中的许多具有与当前生物学不同的生物学功能。研究人员说,许多人类的基因都有可以改变的重复片段,这个过程更类似于人类从猿类进化而来的基因改变。爱尔康表示:“新的基因测序方法会更快,成本会更便宜,这将为未来的研究提供一个新的平台。这最终会导致更全面的基因突变现象的理解。”目前,该团队已经接触了1,000预计世界各地的基因组计划将在全球范围内进行,并且预计将可以接触到来自世界各地的数百人的基因组。研究小组认为,准确和系统地确定人类基因组中的重复基因片段对于人类多样性具有重要价值,并且在个体基因组图谱的绘制中尤为重要。是否将“这一个”与“那个”区分开的关键因素“。
 

  关键词:技术美国纸张项目出版

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