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少量RNA也能进行高通量的miRNA表达图谱分析

  少量的RNA也可以进行高通量的miRNA表达谱分析

  比利时根特大学医学遗传学中心Vandesompele和Speleman的实验室正在研究神经母细胞瘤的遗传基础。博士生Pieter Mestdagh正在研究miRNA在神经母细胞瘤发病机制中的作用。他和他的同事们最近开始使用Applied Biosystems工具来绘制大量神经母细胞瘤样本中的数百个miRNA [1]。应用生物系统Megaplex RT引物和预扩增步骤,TaqMan实时定量RT-PCR分析多个同时检测400个miRNA的表达。 Megaplex RT引物是一种新的具有茎环结构的逆转录引物杂合文库,可在单个实验中简化数百个miRNA靶标的分析。 Megaplex PreAmp引物显着提高了低表达miRNA在单细胞(2pg总RNA)样品中定量miRNA的能力。这项研究表明,预扩增法提高了miRNA检测的灵敏度,低至10 ng的RNA可以成功进行模式分析。在预扩增步骤中,相对表达水平保持不变,而可检测的miNRA的数量增加。此外,这种方法可以再现以前发表的miRNA差异表达结果,从而得到验证[2,3]。这些结果强调了Megaplex RT引物和Megaplex PreAmp引物成功地用于从少量起始材料中可靠和高通量的miRNA表达谱的事实。这些工具可以简化对神经母细胞瘤中miRNA的作用的研究。
 

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