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少量细胞多层次图谱绘制技术问世

  少量的蜂窝多级映射技术可用

  解析正常和病理过程的强大工具是全基因组分子和表观遗传图谱。获得完整的细胞功能图最重要的挑战之一是开发一种可以表征少量细胞多层图的技术。最新一期“自然方法”的两个问题解决了这个问题。
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15年来,从生物芯片到最新的单分子测序平台,已经有了很多研究基因组图谱的方法。然而,由于每个器官由不同类型的细胞组成,其中许多细胞很小,这导致对表观和转录组的细胞分布的缓慢研究。
\\ u0026>美国Helicos Biosciences公司的Fatih Ozsolak及其同事发明了一种名为“小数基因表达(LQ-DGE)”的新方法。作者使用该方法定量少至250个细胞。通过从聚(dT) - 浮选流动细胞捕获poly(A)+ mRNA并完成cDNA合成和测序直接减少Helicos DGE方法,可以在不扩增的情况下获得它们的mRNA谱,而无需扩增在细胞表面进行样品处理并提高样品的灵敏度。
\\ u0026>美国马萨诸塞州综合医院的Bradley E Bernstein小组介绍了“染色质免疫沉淀与高通量测序相结合的有限的小鼠造血祖细胞(ChIP-seq)”。作者使用ChIP-seq来绘制1000个细胞的组蛋白修饰图小鼠造血祖细胞的发育模式。随着技术的提高,很少有人预期多层细胞图将成为现实,我们预计将会看到遗传,基因表达,全基因组水平的特定细胞的DNA和组蛋白修饰图谱。

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